Ново-Алексеевский монастырь был основан еще в 1358 году, но за время существования несколько раз менял свое «место прописки». Изначально он располагался в центре Москвы, но в XVII веке переехал на окраину, в Красное Село. В монастыре работали разнообразные мастерские, а в 1871 году здесь открылась первая в России школа для южных славян. К XX веку на территории обители действовали 42 храма, среди которых и шедевр русской архитектуры XVII века — храм Алексия Человека Божия.

В 1926 монастырь был разрушен, а в 1991 году начались работы по его восстановлению: создан приход и сестричество, на базе которых в 2012 году была организована монашеская община. Летом 2013 года монастырь был окончательно возрожден как Алексеевский женский монастырь.